Años más tarde, se afiliaron a la FIFA finalmente en un esfuerzo conjunto por el desarrollo del fútbol. Dicho uniforme estaba basado en aquel que usaba el equipo argentino Tigre, equipo del cual Fernando Paternoster era hincha. Ya en los 90’s empieza con un contrato por dos años con Saeta, tras terminar dicho contrato vuelve a firmar por dos años con Torino. Dicho uniforme y colores se mantendrían hasta 1939, cuando después de la desvinculación del municipio, el club cambia de nombre, escudo y colores oficiales. La camiseta ANCONE en los colores del club aportará comodidad y ligereza a tus conjuntos de todos los días. No obstante los diseños serían descartados, razón por la cual se jugarían algunos partidos con el uniforme Umbro de la temporada 94-95. Para el segundo semestre del año regresa la alemana Adidas, la cual junto al patrocinio de Cerveza Leona darían paso a una de las camisetas más recordadas de la historia del club, sin embargo también habrían problemas con la indumentaria, aduciéndole ‘mala suerte’. Para las temporadas 2007/08 y 2008/09 el Deportivo vestirá las camisetas creadas por Canterbury of New Zealand, empresa que tendrá problemas para suministrar la indumentaria por problemas económicos en su segunda temporada con el Deportivo, por lo que desde la temporada 2009/10, el Deportivo viste con Lotto.
En la Asamblea Ordinaria del Deportivo a mediados de 1990, la directiva deportivista sacó adelante la idea de dotar de una nueva y más moderna indumentaria al Deportivo. ↑ «Negra con gris: conozca la nueva camiseta de Millonarios». ↑ «Millonarios presentó su nueva camiseta dorada». Se recurrió a una equipación que constó de camiseta blanca, pantaloneta negra y medias negras con una franja blanca. El 13 de agosto de 1939 se utilizó por primera vez en la historia del club el emblemático uniforme azul, en esa ocasión combinado con pantaloneta azul y medias grises. Por ello, el club va ahora a por el trofeo definitivo, la Liga de Campeones, para ser considerado el mejor club de Europa y probablemente del mundo. Entre sus mejores actuaciones destaca un título de la Copa Mundial de Fútbol, en la edición en la que fueron locales, en 1966, también quedó en cuarto lugar en 1990 y 2018, además ocupa el tercer lugar en la Copa del Mundo detrás de Brasil y Alemania en cuanto a presencia en cuartos de final (11 veces en 15 apariciones). Finalizaron en el séptimo lugar de la tabla general del torneo. Durante los primeros 6 meses se utiliza una equipación provisional sin marca, finalmente el diseño definitivo llega para el Torneo Finalización 2003, el cual presenta por primera vez la inclusión de un tercer color, siendo este el negro.
En la segunda y tercera equipación sí hubo importantes novedades. Joma y Deportivo amplían su vinculación hasta la campaña 2006/07. La mayor innovación se produce en la primera equipación de la temporada 2006/07, con dos rayas horizontales atravesando a la altura del pecho en todas las equipaciones (de color azul y negro en la primera, blanco y azul en la segunda y negro y blanco en la tercera). Nuevamente se cortaría el contrato con la marca alemana, lo que llevó a que en un periodo de tiempo Millonarios usara hasta 4 uniformes de marcas distintas: El diseñado por Adidas, el provisional de Saeta, uno de una desconocida marca Wala, y finalmente uno de la marca colombiana Torino. El patrocinio de Fadesa finaliza en 2008, después de un periodo sin publicidad en la camiseta se acaba firmando con Estrella Galicia como nuevo patrocinador. Los estatutos federativos no contemplan que el nombramiento del presidente deba hacerlo la junta directiva, como así sucedió. Se utilizaban camisetas de algodón abotonables, las cuales no presentaban mayor personalización más allá de la numeración reglamentaria, que entonces era bordada en tela en la espalda del jugador.